一种小鼠骨髓极小胚胎样干细胞的分离与鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）骨髓单个核细胞的分离；（2）单个核细胞标记与极小胚胎样干细胞分选；（3）极小胚胎样干细胞RNA的提取；（4）转录PCR检测多能基因的表达；(4.1)反转录，(4.2)PCR反应，(4.3)琼脂糖凝胶电泳；和（5）极小胚胎样干细胞与胚胎干细胞表达谱的比较；（5.1）RNA的提取，（5.2）RNA的浓度测定，（5.3）Illumina法比较。本发明通过抗体标记的方法直接从小鼠的骨髓单个核细胞中分选出一种新的干细胞-极小胚胎样干细胞。这种成体干细胞可以分化成任何三个胚层的细胞，对于组织的再生医学具有重要作用。