本发明采用了高通量单细胞外显子测序技术和严格的生物信息学的分析，发现了肾癌干细胞中的1个特有的显著突变，为KCP基因。根据该特异性突变，设计了一种检测KCP基因突变的方法，并公开了KCP基因突变检测用于鉴别肾癌干细胞的方法。有助于对肾癌基因水平的诊断、分型、治疗靶点的确立提供参考。