本发明涉及一种白茅根提取物的制备方法及其应用，属于天然产物有效成份的分离提取技术领域。本发明以天然香料为基础，经过原料预处理、酶解、第一次微波处理、第二次微波处理、过滤和浓缩制备而成。其采用微波提取法，降低了提取温度，缩短了提取时间，提高了提取效果，将白茅根提取物作为烟用香料使用，能柔和烟香，改善余味、掩盖杂气，提高烟草制品的质量，且此方法设备并不复杂，容易操作，无污染。