本发明公开了一种利用菜籽粕产纳豆激酶的纳豆芽孢杆菌（Bacillus natto F22），其保藏号为：CGMCC 7825，可应用于制备生产纳豆激酶的生物制剂。该菌株是以紫外线和微波诱变处理纳豆芽孢杆菌出发菌株，获得正突变紫外诱变菌株和微波诱变菌株作为基因组改组育种的亲本，采用基因组改组技术(genome shuffling)进行亲本菌株融合，以纳豆激酶的活力为考核指示，于以油脂加工副产物菜籽粕为基本氮源配制的发酵培养基中，反复筛选获得产纳豆激酶性能稳定的优良菌株。采用本发明方法选育的菌株，能利用菜籽粕作为营养基质生产纳豆激酶，能为纳豆激酶的工业化生产、菜籽粕的综合利用以及开发新的保健食品奠定基础。开辟了生产纳豆激酶的新途径。