本发明公开一种经颅磁刺激线圈的半导体冷却装置，设置在刺激线圈结构上，该半导体冷却装置包括半导体制冷片及外散热器，半导体制冷片具有冷端和与冷端串联的热端，冷端和热端分别设置在壳体的内外侧，冷端朝向需要制冷的刺激线圈端，并通过翼状的散热片与刺激线圈结构内的冷却液接触，热端与外散热器紧密连接；冷端从刺激线圈端吸收的热量，通过热端传递给外散热器由散热风扇强制向外散热。本发明利用具有热电能量转换特性的半导体制冷片，在通电时主动吸收刺激线圈工作时产生的大量热量，提高了刺激线圈的散热效果，且体积小、重量轻、无污染、低噪音，低造价、温度控制方便等，从而使刺激线圈的工作时间延长，达到长时间刺激的目的。