本发明公开了一种风力发电机组控制系统升级过程中硬件安全链控制方法，涉及风力发电技术，旨在提供一种使得硬件安全链在控制系统升级过程中不会产生安全链动作的控制方法。本发明技术要点包括：步骤1：当升级模块接收到升级指令后，向硬件安全链控制模块输出升级握手信号；步骤2：硬件安全链控制模块收到握手信号后，向升级模块输出应答信号，同时进入升级模式；步骤3：升级模块收到应答信号后开始接收升级程序，且在升级完成后向硬件安全链控制模块输出升级完成信号；步骤4：硬件安全链控制模块收到升级完成信号后，回到正常模式。