一种微生态制剂及其制备方法与应用，涉及水产养殖。微生态制剂含有枯草芽孢杆菌、短小芽孢杆菌中的至少一种和植物乳杆菌、嗜酸乳杆菌中的至少一种；枯草芽孢杆菌包括枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis1A05680），短小芽孢杆菌包括短小芽孢杆菌（Bacillus pumilus1A08151），植物乳杆菌包括植物乳杆菌（Lactobacillus plantarum1A07806）；嗜酸乳杆菌包括嗜酸乳杆菌（Lactobacillus acidophilus PL7）。在制备促进对虾或石斑鱼生长，提高对虾或石斑鱼免疫力和抗病力，防治病害，提高存活率，净化养殖水质制剂中应用。