本发明涉及市政工程技术领域，尤其涉及一种净水储水单元及设有该净水储水单元的净水储水系统，主要应用于雨水的收集、过滤、净化处理及储存。该净水储水单元的储水容器的容器壁为防水结构；储水容器内部设有出水井和分布在出水井周向的隐形井，所述出水井与隐形井的井壁均为透水结构，在所述出水井及隐形井和所述容器壁之间填充有填料；在所述隐形井和填料的上方铺设有透水表层。出水井和隐形井的井底采用透气防渗与混凝土底板相结合的方式，使得水不会变质，出水井和隐形井不会发生沉降；出水井和隐形井采用六边形蜂窝状结构，结构稳定，且比表面积大，为生物挂膜提供载体，有处理水的功能，且没有能耗。