本发明涉及分子遗传学及生物医药领域，具体为一种特异性降低人Aurora-A基因表达的shRNA及其应用，本发明提供了一种可以特异性降低人Aurora-A基因表达的发夹型干扰RNA，如SEQIDNO.1所示，针对的靶序列为人Aurora-AmRNA第995～1015位，如SEQIDNO.2所示，该shRNA在体内或体外可剪切形成含如SEQIDNO.4和SEQIDNO.5所示的siRNA；还提供了编码该shRNA的DNA寡核苷酸链，如SEQIDNO.3所示，以及包含如SEQIDNO.3所示的DNA寡核苷酸链的质粒。本发明还证明了利用Aurora-A-shRNA干扰载体的药物转染人食管癌EC9706细胞后，细胞中Aurora-A基因的mRNA转录水平、蛋白表达水平明显降低，使食管癌细胞的侵袭能力显著降低，并能促进UV照射诱导的食管癌细胞凋亡，克服了体外化学合成的siRNA作用时间短暂的缺点，为新型抗肿瘤药物的开发提供了新途径。