本发明涉及一种富集弧菌噬菌体与生物防制宿主菌的方法，由于噬菌体的裂解特异性，特定环境和一定状态下的特定宿主菌株的噬菌体不易获得；本方法依据养殖区和海区的弧菌菌株和噬菌体之间在生态和进化上与环境共存的事实，在特定区域设立宿主菌以及噬菌体的长期培养池，可以不断富集、分离该区域特定病原菌宿主的裂解性噬菌体，经过扩增后，再投放于该区域，可以在短时间内控制养殖水体致病菌的增殖，也可以长期抑制该水体病原菌的浓度，起到生态防御的效果。在养殖海水水体利用噬菌体防治病原菌引起的疾病，有高效、生态安全、简易持久的特点。