用于直接接合半导体结构的改善的接合表面。将第一半导体结构直接接合到第二半导体结构的方法包括以下步骤：在导电材料对导电材料直接接合工艺中将第一半导体结构的至少一个器件结构直接接合到第二半导体结构的至少一个器件结构。在一些实施方式中，在接合工艺之前，可使所述第一半导体结构的至少一个器件结构突出一距离，以超过所述第一半导体结构上的相邻的介电材料。在一些实施方式中，所述多个器件结构中的一个或更多个可包括从基础结构延伸的多个整体突起。使用这些方法来制造接合的半导体结构。