本发明公开了一种全光纤结构980nm波段复合腔单模光纤激光器，目的是解决空间光耦合不足和特殊设计双包层光纤带来的器件匹配问题，并克服泵浦功率低、ASE抑制差对于980nm激光器系统输出特性的影响。本发明由N个增益模块、N-1个偏振控制器、耦合模块、输出耦合端和N-1个泄漏端组成；增益模块由2个泵浦模块、2个多波长波分复用器、掺镱光纤、第二光敏光纤、第二光纤布拉格光栅和第一光纤环构成；输出耦合端由第三光敏光纤、长周期光纤光栅和第三光纤布拉格光栅组成；泄漏端由第二光纤环构成。本发明克服了空间光耦合的不足和器件匹配问题；解决了输出功率受限的问题和泵浦功率低、ASE抑制差对于980nm激光器系统输出特性的影响。