本发明公开了一种胎心率基线自动识别算法，该算法包括以下步骤：S1、对胎心率信号进行采集；S2、对上述采集到的胎心率信号进行曲线优化处理；S3、对优化处理后的胎心率信号曲线进行特征提取，并利用聚类分析算法将提取的特征点聚类为两个特征部分；S4、根据区分条件将上述两个特征部分区分为基线部分和非基线部分；S5、对识别出的基线部分进行平滑滤波，从而得到最终估计的胎心率基线。本发明作为一种胎心率基线自动识别算法，尤其是能够在聚类结果相近的情况下，通过结合胎动信息，更准确地判定胎心率基线，为临床提供更加智能、更加可靠的胎心监护结果，可广泛应用于生物医学信号处理领域、人工智能以及电子胎儿监护领域。