本发明涉及水产养殖技术领域，涉及鲜活海产品捕捞后的海上运输技术，具体涉及一种鲜活海产品海上保鲜运输方法及装置。本发明应用自然界中稳定存在的冷水团绿色能源，改进原有海产品捕捞及运输船设备，在高温季节，直接抽取温跃层以下底层低温冷水，温跃层以下底层低温冷水的温度、盐度和其它理化指标接近捕捞及运输的鲜活海产品在海底自然生长的环境，用底层低温冷水冷存鲜活海产品，投资少、改造难度低，减少以往为降低捕捞船和运输船载水体制冷耗能及降低工作人员预冷作业时间，提高工作效率，降低劳动强度，大幅度节能减排，解决了水温波动对海产品活度及鲜度的不利影响的行业难题，符合绿色环保的产业发展需求。