本发明公开了一种提高短时阴影下光伏模组抗失配能力的超级电容补偿方法，对实际工作的光伏发电系统，将串联的光伏电池单元分为若干电池模组，对每一个电池模组并联一个超级电容形成一个带失配补偿电路的电池模组；记电池模组的最佳电压工作区间为U∈(U_L,U_G)，在阴影条件G下电池模组维持在最佳电压工作区间U∈(U_L,U_G)内的持续时间为维持时间T，在维持时间T内的超级电容容量为补偿容量C。本发明给出了光伏电池模组最佳工作区间的确定方法以及不同容量超级电容维持模组电压稳定能力的标准即维持时间，提供了选择超级电容容量的思路，确定一定阴影光强条件下，电容补偿容量与模组维持时间之间的匹配关系的方法。