本发明涉及一种检测肺癌转移标志性SNP的方法及其应用，具体地，本发明涉及一种基因组测序文库及其衍生物及其用途，所述基因组文库待测序的核苷酸片段均一性强，质量高，通过对所述的文库进行测序，比较肺癌组织、转移灶和血清的SNP的特异性，找到转移灶所有特有的、对蛋白结构有重大影响SNP集合。本发明的SNP集合可以用于制备诊断和检测肺癌转移的试剂或试剂盒，为个体化医疗的有效推广与实施，医疗诊断，疾病预防起到指导作用。