本发明公开一种热源互补型斯特林发动机热电联供系统及其方法。碟式二次反射镜将太阳光聚焦到混合热源加热器，混合热源加热器与斯特林发动机的热端相连，斯特林发动机的输出端与发电机相连，冷水箱、水泵、斯特林发动机的冷却器一路、混合热源加热器中的烟气侧换热器与热水箱顺次相连，斯特林发动机冷却器另一路直接与热水箱相连，燃料补充装置、电控阀与混合热源加热器顺次相连，斯特林发动机的输出端、数据采集及检测器、辅助热源控制器、电控阀顺次相连。本发明解决了传统太阳能发电系统电力输出不稳定，持续性差，并网困难的问题，同时系统实现了热电联产，大大提高了太阳能热发电并网的竞争力和系统整体的经济效益。