本发明涉及一种超级电容器和蓄电池混合储能的控制装置及方法，可再生能源发电系统经直流母线接负载，超级电容器组和蓄电池组分别接直流母线，其特征在于：超级电容器组连接线路上设有多个开关管，通过多个开关管的通断可实现超级电容器组串联和并联模式之间的切换，还设有电容器组控制单元，电容器组控制单元的信号输出端接超级电容器组连接线路上开关管的控制端；蓄电池组连接线路上设有多个开关管，通过多个开关管的通断可实现蓄电池组串联模式和并联模式之间的切换，还设有蓄电池组控制单元，蓄电池组控制单元的信号输出端接蓄电池组连接线路上开关管的控制端；电容器组控制单元和蓄电池组控制单元分别接有采样单元，采样单元信号输入端接直流母线。