本发明提供一种压载水处理装置，其对取入的被处理水进行过滤，对过滤后的被处理水照射紫外线而将进行紫外线处理后的处理水向压载箱积存，其中，在压载水处理管线(1)上具备汲取被处理水并将其压力输送的泵(2)、对汲取的被处理水进行过滤的过滤器(3)、对过滤后的被处理水进行紫外线照射的紫外线反应器(4)、对进行紫外线处理后的处理水进行积存的压载箱(5)、船外排出机构(6)，在从被处理水的汲取开始的规定时间内，使汲取的被处理水不通过过滤器(3)和紫外线反应器(4)地由船外排出机构(6)向船外排出，当经过规定时间时，停止由船外排出机构(6)进行的船外排出，将进行过滤器(3)中的过滤和紫外线反应器(4)中的紫外线处理后的处理水向压载箱(5)注入，从而能够可靠且效率良好地进行压载水的杀灭处理。