本发明涉及一种降低金线莲组培污染率的方法及其培养基配方。技术方案是：一种降低金线莲组培污染率的培养基配方，其特征在于所述的培养基配方为1/2MS、香蕉40～60g/L、活性炭0.8～1.2g/L、NAA0.8～1.2mg/L、6-BA0.4～0.8mg/L、蔗糖22～30g/L、琼脂粉5.5～6.5g/L、洋葱40～60g/L、螃蟹壳粉10～20g/L。培养基配方降低金线莲组培污染率的方法，其特征在于包括以下步骤：1）接种室消毒；2）培养室消毒：3）培养基配制；4）培养基和接种器具灭菌；5）外植体接种；6）组培苗培养。