本发明属于微生物多糖的制备，特别是指一种采用胶质类芽孢杆菌生产微生物絮凝剂的方法。采用热冲击方法对胶质类芽孢杆菌ACCC10013进行菌种驯化，在含有碳源、氮源和生长因子的无菌发酵培养基内通气培养步骤A中驯化后的胶质类芽孢杆菌ACCC10013，获得含有微生物絮凝剂的发酵液，采用大孔吸附树脂对步骤B中制备的含有微生物絮凝剂的发酵液进行分离，制成微生物絮凝剂。本发明解决了现有技术存在的成本高、絮凝剂的纯度低等问题，具有制备过程工艺成本低、收率高、产品纯度及活性高等优点。