本发明涉及电容均衡相关技术领域，特别是一种多并串超级电容系统均衡方法。所述超级电容由多个单体电容通过串联和/或并列方式组合而成，所述系统包括：超级电容和控制器，在每个单体电容两端分别并联一个放电电阻，每个放电电阻串联一个开关模块，每个开关模块与控制器连接，受控制器控制导通或截止，从而控制放电回路的通断。本发明通过设计被动式均衡电路，配合合适的均衡策略，提高电容组整体性能，提高电容使用率，延长电容组使用寿命。本发明的均衡方案简单、可靠、抗干扰能力强。借助串行通讯模块，大大节省控制器引脚资源。