本发明涉及药物化学领域，具体公开了一种芳基钌-β-咔啉配合物及其制备方法和应用。所述的芳基钌-β-咔啉配合物为[Ru(η⁶-arene)(N–N)Cl](PF₆)，其中η⁶-arene为芳基配体对-伞花烃（p-cymene，CYM）或苯（benzene，Ben），N–N为β-咔啉生物碱衍生物1-(2-吡啶)-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚（L1）、1-(2-喹啉)-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚（L2）或1-(2-咪唑)-9H-吡啶并[3,4-b]吲哚（L3）。本发明所述配合物在体外抗肿瘤筛选中表现出非常突出的活性，且与癌细胞株相比，它们对正常细胞的毒性大幅度降低，具备良好的抗肿瘤药物开发潜能。