本发明涉及一种含有艾普拉唑钠组合物的复方胶囊及其制备方法，该胶囊是由艾普拉唑钠肠溶微丸、克拉霉素缓释微丸和阿莫西林缓释微丸组成，处方中主要含艾普拉唑钠5-10mg，克拉霉素400-600mg，阿莫西林900-1100mg。该胶囊对治疗消化性溃疡有显著的作用，具有药物起效快，作用强，能够提高生物利用度，彻底杀灭幽门螺杆菌、服用方便及价格便宜的优点。